Hfdst 8 : Shotgun sequencing

Live forum: /viewtopic.php?t=10548

Stéphanie Delvaux

17-06-2007 19:42:33

Heellooooow

ik snap de shotgun sequencing niet echt! (pag 217 en 219)
Is er iemand die me dat kan uitleggen?
En die STS worden die als markers gebruikt??
En voor wat worden die EST nu precies gebruikt?
Iemand die me dit allemaal kan uitleggen is heeel erg bedankt!!
Succes met de examens nog!!

einsteincaller

18-06-2007 09:43:49

Bij shotgun sequencing wordt het DNA in stukken geschoten door middel van sonificatie (geluidsgolven).
Dan wordt er van die stukken de DNAsequentie bepaald aan de hand van PCR met dideoxynucleotiden.

STS'en kunnen gebruikt worden om overlappende sequenties te vinden i DNA. Want STS'en zijn unieke plaatsen op het genoom.

EST's zijn gebruikt geweest om een transcriptkaart te maken. Dat zijn unieke sequenties gevonden op cDNA. Die EST's kunt ge dan vb merken en laten hybrydiseren op uw volledig gewoon DNA en zo ziet ge dan waar de genen van uw cDNA zich op het genoom bevinden.

Dat is toch hoe ik het heb begrepen.