11-6-10

Live forum: /viewtopic.php?t=20886

leob

12-06-2010 07:50:09

1) zoek een gen op in ucsc. downloaden met wat extra. geneid op doen. custom track uploaden. komt het deftig overeen? regulatorische tracks zichtbaar maken. 1 subset uit die tracks halen (tricky), als custom track uploaden. fuzznuc op doen, als custom track uploaden. komt het deftig overeen? PPV op doen.

2)genetische ziekte gegeven (cf). zoek het gen. aantal transcripten? homologen? eiwitdomeinen? (allemaal ewa basic stuff eigenlijk)

3)go term gegeven. zoek aantal genen bij mus musculus met die annotation. die allemaal downloaden. checken in linux of het hetzelfde aantal is. (dat is niet zo, er zijn dubbele. ge moet de kolom met de gennamen cutten en daarop sort -u doen om alleen de dubbele te hebben. dan wc -l natuurlijk)

marjolein

16-06-2010 18:17:02

Bij het eerste: bepaalde sequentie zoeken voor binden van Kr ofzoiets... Niet vergeten ook op de reverse strand te zoeken!